枯草桿菌（學名：Bacillus subtilis）是芽孢桿菌屬的一種細菌，為革蘭氏陽性的好氧性菌，普遍存在於土壤及植物體表，形態上的主要特徵是菌體表面生有鞭毛，體內形成的內生孢子可抵抗惡劣的外在環境而存活。能夠形成耐高溫、耐乾燥、耐酸、耐鹼等多種環境條件下生存的芽孢，使其在廣泛的環境中具有競爭優勢。

​

此外，枯草桿菌也具有多種代謝途徑，能夠利用多種碳源進行生長，並且能夠產生多種生物活性物質，如酵素、抗生素、抗氧化劑等。在人體亦可發現在腸道內共生的枯草桿菌。曾有文獻指出，枯草桿菌至少有66種不同的抗生物質，枯草桿菌在食品、飼料添加物、酵素、以及種子保護劑等生技產業上，已應用多年，臨床醫學上是屬於安全性的有益微生物。 枯草桿菌對病原真菌和細菌具有拮抗作用，可以產生許多代謝產物和抗生物質。